2016年第3週の定点当たり報告数は10.56（患者報告数52,226人）となり、前週の定点当たり報告数4.11よりも増加した。都道府県別では新潟県（29.28）、沖縄県（18.22）、青森県（16.45）、千葉県（14.13）、福岡県（13.68）、神奈川県（13.06）、岩手県（12.75）、埼玉県（12.70）、長野県（12.67）、秋田県（12.22）、岐阜県（12.21）、山口県（12.04）、愛知県（11.92）、北海道（11.91）、茨城県（11.90）、東京都（11.17）、山梨県（10.73）の順となっており、全47都道府県で前週の報告数よりも増加がみられた。
　全国の保健所地域で警報レベルを超えているのは10箇所（7道府県）であり、注意報レベルを超えている保健所地域は228箇所（41都道府県）であった。
　定点医療機関からの報告をもとに、定点以外を含む全国の医療機関をこの1週間に受診した患者数を推計すると約52万人（95%信頼区間：48〜57万人）となり、前週の推計値（約23万人）よりも増加した。年齢別では、5〜9歳が約12万人、0〜4歳、10〜14歳、30代、40代がそれぞれ約6万人、20代、50代がそれぞれ約4万人、15〜19歳、60代がそれぞれ約3万人、70歳以上が約2万人となっている。また、2015年第36週以降これまでの累積の推計受診者数は約109万人となった。
　基幹定点からのインフルエンザ患者の入院報告数は453例であり、前週（286例）より増加した。44都道府県から報告があり、年齢別では0歳（25例）、1〜9歳（158例）、10代（20例）、20代（5例）、30代（16例）、40代（16例）、50代（24例）、60代（52例）、70代（64例）、80歳以上（73例）であった。
　国内のインフルエンザウイルスの検出状況をみると、直近の5週間（2015年第52週〜2016年第3週）ではAH1pdm09の検出割合が多く、次いでB型、AH3亜型の順であった。
　詳細は国立感染症研究所ホームページ（http://www.nih.go.jp/niid/ja/flu-map.html）を参照されたい。