2013/2014年シーズンのインフルエンザの定点当たり報告数は2013年第43週以降増加が続いている。第52週の定点当たり報告数は1.90（患者報告数9,307）となり、前週の定点当たり報告数（1.39）を上回った。都道府県別では鹿児島県（5.87）、長崎県（5.31）、高知県（4.96）、沖縄県（4.66）、山口県（4.29）、大分県（3.74）、熊本県（3.68）、佐賀県（3.56）の順となっており、41都道府県で増加がみられた。注意報レベルを超えた保健所地域は11箇所（北海道1、秋田県1、群馬県1、静岡県1、香川県1、高知県1、長崎県3、大分県1、鹿児島県1）認められたが、警報レベルを超えた保健所地域は存在していない。
　基幹定点からのインフルエンザ患者の入院報告数は79例であり、第51週（72例）より増加した。30都道府県から報告があり、年齢別では0歳（5例）、1〜9歳（24例）、10代（12例）、20代（2例）、30代（3例）、40代（3例）、50代（3例）、60代（5例）、70代（11例）、80歳以上（11例）であった。
　2013年第36〜51週の16週間では、インフルエンザウイルスの検出は、AH3亜型（A香港型）の割合が最も多く、次いでAH1pdm09、B型の順となっている。詳細は国立感染症研究所感染症疫学センターホームページ（http://www.nih.go.jp/niid/ja/iasr-inf.html#graph）を参照されたい。