2012/2013年シーズンのインフルエンザの定点当たり報告数は2012年第43週以降増加が続いている。第50週の定点当たり報告数は1.17（患者報告数5,789）となり、全国的な流行開始の指標である1.00を初めて上回った。都道府県別では佐賀県（8.11）、群馬県（6.87）、沖縄県（3.79）、山梨県（3.08）、埼玉県（2.28）、千葉県（2.27）、栃木県（2.03）、新潟県（2.03）の順となっており、青森県、秋田県、岡山県を除く44都道府県で増加が認められた。
　注意報レベルを超えた保健所地域は6箇所（群馬県2、千葉県、佐賀県、長崎県、大分県各1）に増加したが、警報レベルを超えた保健所地域は存在していない。
　2012年第36〜50週の15週間では、インフルエンザウイルスの検出は、AH3亜型（A香港型）の割合が最も多く検出されている。詳細は感染症情報センターホームページ（http://www.nih.go.jp/niid/ja/iasr-inf.html#graph）を参照されたい。