2011年第13週のインフルエンザの定点当たり報告数は10.02（患者報告数48,290）となり、2週連続で減少した。第12週に続いて岩手県の一部と福島県からの報告はなかった。
　定点医療機関からの報告をもとに、定点以外を含む全国の医療機関をこの1週間に受診した患者数を推計すると約47万人（95%信頼区間：41万人〜52万人）となり、年齢群別では5〜9歳約16万人（34.0%）、0〜4歳約9万人（19.1%）、10〜14歳約8万人（17.0%）、20代約4万人（8.5%）、30代約4万人（8.5%）の順であった。5〜14歳の年齢層の減少が続いている。
　都道府県別では宮崎県（26.41）、大分県（25.67）、石川県（21.10）、福岡県（19.34）、高知県（18.35）、山口県（17.51）、広島県（17.23）、山梨県（17.15）の順である。報告のなかった福島県を除く46都道府県中33都道府県で定点当たり報告数の減少が認められた。増加が認められた13県のうち、東北地方では青森県、宮城県の定点当たり報告数が微増した。
　警報レベルを超えている保健所地域は114箇所（31道府県）、注意報レベルのみを超えている保健所地域は78箇所（30道府県）と共に減少した。なお第13週は、東京都においては、集計後にデータの修正操作が行われたことにより、その後の患者数推計値及び地図作成にデータが反映されていない。
　2011年第9〜13週の5週間のインフルエンザウイルス検出報告件数は、AH3亜型（A香港型）が最多であり、次いでB型、AH1pdmの順である。2011年第7週以降はAH3亜型の検出数が最多となっていたが、B型の検出割合も増加してきている。詳細は感染症情報センターホームページ（http://idsc.nih.go.jp/iasr/influ.html）を参照されたい。