2009年第50週のインフルエンザの定点当たり報告数は27.39（患者報告数131,972）となり、2週連続で減少した。第28週より報告数は増加傾向となり、第33週に定点当たり報告数が1.00を超えて始まった今回の秋季に大きな増加がみられた流行は、そのピークを過ぎつつあるものと考えられる。
　定点医療機関からの報告数をもとに、定点以外を含む全国の医療機関を1週間に受診した患者数を推計すると約132万人（暫定値）となり、第28週以降これまでの累積の推計患者数は約1,546万人（95%信頼区間：1,528万人〜1,564万人）（暫定値）である。
　定点当たり報告数は、都道府県別では宮崎県（55.51）、福井県（53.78）、徳島県（39.59）、長野県（38.56）、長崎県（38.51）、青森県（38.43）、山口県（38.35）、福島県（38.05）、大分県（37.83）、愛媛県（37.26）の順となっている。定点当たり報告数は、北海道、東京都、神奈川県、山梨県を除く43府県で20.00を上回り、26県で30.00を上回っているが、41都道府県では前週よりも減少した。
　警報レベルを超えている保健所地域は432箇所（47都道府県）となり、注意報レベルのみを超えている保健所地域は71箇所（28都道府県）となった。
　インフルエンザの報告数が増加し始めた第28週以降、検出されているインフルエンザウイルスの殆どが新型インフルエンザウイルスAH1pdmである状態が続いており（感染症情報センターホームページ：http://idsc.nih.go.jp/iasr/prompt/graph/sinin1.gif参照）、最近の発生患者の殆どが新型インフルエンザに罹患しているものと推定される。