2009年第49週のインフルエンザの定点当たり報告数は31.82（患者報告数153,131）となり、前週よりも大きく減少した。定点医療機関からの報告数をもとに、定点以外を含む全国の医療機関を1週間に受診した患者数を推計すると約150万人となり、第28週以降これまでの累積の推計患者数（暫定値）は約1,414万人（95%信頼区間：1,396万人〜1,432万人）である。
　都道府県別では福井県（60.66）、大分県（54.69）、山口県（54.46）、宮崎県（52.83）、徳島県（51.03）、佐賀県（50.85）、長崎県（48.24）、青森県（46.63）、愛媛県（45.07）、石川県（44.60）の順となっている。定点当たり報告数は、北海道と東京都を除く45都府県で20.00を上回り、32県で30.00を上回っているが、青森県と徳島県を除く45都道府県では前週よりも減少した。
　警報レベルを超えている保健所地域は435箇所（47都道府県）となり、注意報レベルのみを超えている保健所地域は82箇所（30都道府県）となった。
　インフルエンザの報告数が増加し始めた第28週以降、検出されているインフルエンザウイルスの殆どが新型インフルエンザウイルスAH1pdmである状態が続いており（感染症情報センターホームページ：http://idsc.nih.go.jp/iasr/prompt/graph/sinin1.gif参照）、最近の発生患者の殆どが新型インフルエンザに罹患しているものと推定される。