2009年第12週のインフルエンザの全国レベルでの定点当たり報告数は15.63（報告数74,610）となり、前週よりも減少した。都道府県別では山形県（41.8）、宮城県（37.0）、新潟県（28.8）、石川県（27.2）、鹿児島県（26.9）、富山県（25.0）、秋田県（24.8）、宮崎県（24.8）の順となっており、27都府県で前週よりも減少がみられた。警報レベルを超えている保健所地域は179箇所（41都府県）と前週と比べて減少したが、注意報レベルのみを超えている保健所地域は157箇所（43都道府県）と増加した。
　2008年第36週以降これまでに、インフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型2,661件、AH3（A香港）型1,249件、B型761件が報告されている。