2009年第9週のインフルエンザの全国レベルでの定点当たり報告数は13.49（報告数64,528）となり、第8週よりも増加した。都道府県別では山形県（21.6）、徳島県（21.2）、新潟県（20.6）、長崎県（19.6）、宮城県（19.4）、宮崎県（19.2）、千葉県（19.1）、熊本県（19.1）、静岡県（19.1）の順となっており、31都道府県で前週よりも増加がみられた。警報レベルを超えている保健所地域は216箇所（43都府県）と減少したが、注意報レベルのみを超えている保健所地域は97箇所（40都道府県）と増加した。
　2008年第36週以降これまでに、インフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型2087件、AH3（A香港）型1042件、B型459件が報告されている。