インフルエンザの定点当たり報告数は2007年第42週以降増加が続き、第47週には全国的な流行開始に指標である1.0を上回った。その後も定点当たり報告数の増加は継続し、第50週の報告数は5.67（患者発生報告数26,983）となり、都道府県別では北海道（18.8）、青森県（18.6）、和歌山県（15.9）、岡山県（13.4）、山梨県（11.2）、兵庫県（11.1）、埼玉県（9.6）、千葉県（8.9）、神奈川県（8.8）の順となっている。警報レベルを超えている保健所地域は14箇所（北海道9、青森県1、和歌山県1、岡山県1、広島県2）に、注意報レベルのみを超えている保健所地域は68箇所（18都道府県）と共に増加した。
第36週以降、これまでにインフルエンザウイルスの検出はAH1亜型（Aソ連型）415件、AH3亜型（A香港型）51件、B型8件が報告されている。