感染症発生動向調査によれば、全国レベルでの定点当たり報告数は第27週は0.34と減少が続いている。都道府県別では、沖縄県（13.1）、青森県（2.3）、岩手県（0.9）、長崎県（0.8）の順となっている。
注意報レベルのみを超えている保健所地域は1箇所（沖縄県）、警報レベルを超えている保健所地域は2箇所（沖縄県）とどちらも減少した。
2005年第36週以降これまでに、PCR検査結果を含めたインフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型1,328（25.6%）、AH3（A香港）型3,417（66.0%）、B型435件（8.4%）の計5,180報告されている。