感染症発生動向調査によれば、全国レベルでの定点当たり報告数は第20週は0.87と再び増加した。都道府県別では沖縄県（3.7）、北海道（3.5）、愛媛県（2.9）、青森県（2.5）、鳥取県（2.4）の順である。
注意報レベルのみを超えている保健所地域は3箇所（北海道2、福岡県1）であり、警報レベルを超えている保健所地域はない。
2005年第36週以降これまでに、インフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型1,250件（26.1%）、AH3（A香港）型3,326件（69.4%）、B型216件（4.5%）の計4,792件が報告されている。なお、第17週以降第20週までではAH1型18件、AH3型2件、B型49件がこれまで報告されており、B型の検出の割合が高くなっている。