感染症発生動向調査によれば、全国レベルでの定点当たり報告数は第4週をピークとして以降は減少が続いており、第11週は3.82であった。都道府県別では高知県（26.3）、北海道（12.7）、新潟県（10.3）、長野県（9.3）、石川県（7.4）の順となっている。
注意報レベルのみを超えている保健所地域は23（17都道県）と減少し、警報レベルを超えている保健所地域も22（8道府県）と減少が続いている。
2005年第36週以降これまでに、インフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型820件（21.3%）、AH3（A香港）型2,952件（76.6%）、B型82件（2.1%）の計3,854件が報告されている。