感染症発生動向調査からは、全国レベルでの定点当たり報告数は17.4と3週連続して減少しているが、都道府県別では長野県（37.4）、愛知県（36.7）、富山県（34.2）、高知県（31.6）、石川県（29.8）が多い。
注意報レベルのみを超えている保健所地域は127（36都道府県）と更に減少し、警報レベルを超えている保健所地域も258（42都道府県）も減少が続いている。
2005年第36週以降これまでに、インフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型354件（15.8%）、AH3（A香港）型1868件（83.3%）、B型20件（0.9%）の計2242件報告されている。