2005年第48週は、感染症発生動向調査からは、全国レベルでの定点医療機関当たり報告数は0.41と前週の0.24より更に増加した。また、熊本県に続いて大阪府でも、管内に注意報レベルを超えた保健所が認められている。今のところ警報レベルを超えている保健所地域はない。都道府県別では、山形県（定点あたり報告数2.3）、山梨県（2.0）、熊本県（1.9）、岡山県（1.8）、長野県（1.5）、岩手県（1.3）、福島県（1.0）の7県が1.0を超えている。第36週以降、これまでにインフルエンザウイルスの検出はAH1（Aソ連）型9件、AH3（A香港）型59件の計68件が報告されている。